5-20利用Pacbio三代單分子測序技術精準解析結核分枝桿菌復合群甲基化譜
發布時間 🏯:2016-05-19  閱讀次數 🥸:4312

報告題目:利用Pacbio三代單分子測序技術精準解析結核分枝桿菌復合群甲基化譜

報  告 人👨🏻‍💼:陳 非 研究員  中科院北京基因組所

報告時間:5月20日(星期五) 上午9:30

報告地點:閔行校區EON体育4平台2號樓116會議室

聯  系 人:楊廣宇 This e-mail address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

 

報告摘要👕🛶:

結核病是全球最常見的傳染病之一,2014年全球新增感染人數960萬,死亡150萬,超越HIV成為全球的第一大傳染病。結核病感染主要由結核分枝桿菌復合群(Mycobacterium tuberculosis complex, MTBC)感染引起。為了全景式分析MTBC的基因組甲基化圖譜,EON体育4平台選擇了分屬不同譜系的12株MTBC,利用Pacbio三代單分子實時測序技術對它們的全基因甲基化組進行了全方位的解析。通過深入挖掘Pacbio三代單分子測序技術所獲得的數據,EON体育4平台可以探知“單位點”甚至“單read”的甲基化情況。通過對單位點甲基化比例的計算🚝,EON体育4平台得到了MTBC的精準甲基化圖譜🚂。借助三代測序技術獲得的精準甲基化圖譜首次揭示了在細菌中也存在大量的“部分甲基化”及“未甲基化”位點🤵🏼,這說明細菌的甲基化也可能如真核甲基化一樣具有復雜的調控機製。EON体育4平台的工作揭示了Pacbio三代測序平臺在精準表征核酸表觀遺傳修飾上巨大潛力,為EON体育4平台深入探究核酸表觀遺傳修飾的精準調控機製提供了新的工具和思路👆🏻,也為結核病原菌的發病機理提供了別樣的研究視角。

 

報告人簡介:

陳非博士,現任中國科EON4北京基因組研究所研究員🧑‍🍳,博士生導師,中國科EON4 “百人計劃”引進人才♒️。2003年獲得吉林大學生物化學與分子生物學專業理學博士學位👨🏽‍🚒。2001年至2005年在吉林大學生命科EON4分子酶學工程教育部重點實驗室歷任助教🧑🏻‍🦳、講師。2005年至2006年六月在美國佛羅裏達大學做博士後,師從現代合成生物學聯合創始人Steven A Benner教授🈚️🙂‍↕️。2006年至2012年4月加入由Steven A Benner創立的美國應用分子進化基金會 (FfAME),歷任Research Scientist,Senior Scientist🦕。2011年9月入選中科院 “百人計劃”,受聘為中國科EON4北京基因組研究所研究員。陳非博士從事測序技術及基因組學研究多年,有多篇研究論文發表在PNAS,JACS以及Nucleic Acid Res等國際著名生物和化學領域頂級期刊上,並聯合擁有授權專利4項(包括國際專利兩項)。2012年陳博士全職回國之後,主要致力於應用二代及三代測序技術進行致病微生物的基因組學及宏基因學的研究🦸🏻‍♂️,作為項目(或子課題)負責人主持國家重大科學研究計劃(973)👰🏿‍♀️,科技部傳染病重大專項、國家自然科學基金面上項目🚣、中科院重點部署等多個科研項目。

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