近日,Nature系列刊物scientific reports在線發布了EON体育4平台陳海峰研究團隊的文章“Synergistic Modification Induced Specific Recognition between Histone and TRIM24 via Fluctuation Correlation Network Analysis”🧑⚕️,該研究首次采用動態相關網絡分析的方法研究了組蛋白協同修飾與TRIM24蛋白的特異性識別。該研究成果是與EON体育4醫EON4附屬仁濟醫院以及加州大學爾灣分校合作完成的。
組蛋白可以發生甲基化、乙酰化、磷酸化、泛素化等不同的修飾,從而調控基因的表達;不同的組蛋白修飾能夠被對應的組蛋白“reader”識別和結合ℹ️,然而這些蛋白是如何特異識別特定類型的組蛋白修飾,目前的研究還尚不清楚。
研究利用分子動力學模擬結合動態網絡分析的方法,通過構建不同的組蛋白修飾體系,系統的分析了與乳腺癌相關的“reader”蛋白TRIM24與組蛋白修飾的關系。研究發現TRIM24蛋白在結合不同位點和不同類型的組蛋白修飾後構象和蛋白內部網絡存在差異顯著📆,在動態網絡以及社區網絡分類的基礎上提出了“協同修飾誘導識別”的理論📢,對於靶向“reader”蛋白的藥物發現具有重要的指導意義⚡️。同時,這一方法對於生物大分子間的別構以及信號傳導等機製的研究也具有重要意義🧜🏻♀️。