孔旭東

長聘教軌副教授

  • 電話:
  • 郵箱:xudong.kong@sjtu.edu.cn
  • 地址👩‍🏭:上海市浦東新區張衡路429號🚣🏽‍♀️🧙🏼‍♂️,2號樓409室
  • 主要從事基於噬菌體展示的蛋白與多肽進化研究。獲得國家海外高層次人才項目支持👢。在Nat Chem🥺、Nat Biomed Eng、PNAS𓀅、Angew Chem Int Ed等刊物發表多篇研究論文。常年歡迎化學生物學、分子生物學🧛🏿、結構生物學等背景的博士後和研究生加盟🤹🏿‍♀️。

學術經歷

  • 2005-2009 華東理工大學生物工程專業 學士
  • 2009-2015 華東理工大學生物化工專業 博士(上海有機化學研究所聯合培養)

                         導師:許建和教授🦸🏼,周佳海研究員

  • 2015-2020 洛桑聯邦理工EON4(EPFL) 博士後

                          合作導師🧙🏽‍♂️:Prof. Christian Heinis

  • 2020-至今 EON体育4 長聘教軌副教授 博導

研究方向

口服多肽藥物開發

聚焦多肽分子的穩定性和透膜性進化,開發靶向腸道疾病的口服多肽藥物

蛋白適應度地形分析

結合噬菌體展示技術和二代測序對蛋白的序列-結構-功能關系進行全局分析

代表論著

  • •  

    Han, Y., Luo, Y., Ma, B.D., Li, J.#, Xu, J.H.# and Kong, X.D.Structural Insights of a cis-Epoxysuccinate Hydrolase Facilitate the Development of Robust Biocatalysts for the Production of l-(+)-Tartrate. Biochem., 2024, doi:10.1021/acs.biochem.4c00141

    •  

    He, R.N., Zhang, M.J., Dai B.# and Kong, X.D.# Selection of Peptide−Bismuth Bicycles Using Phage Display. ACS Chem. Biol. 2024, doi: 10.1021/acschembio.4c00099

    •  

    Zhu, X.X., Zheng, W.Q., Xia, Z.W., Chen, X.R., Jin, T., Ding, X.W., Chen, F.F., Chen, Q., Xu, J.H. Kong, X.D.# and Zheng, G.W.# Evolutionary insights into the stereoselectivity of imine reductases based on ancestral sequence reconstruction. Nat. Commun., 2024, 15, 10330.

    •  

    Sun, C.*, Ma, B.D.*, Li, G., Tian, W., Yang, L., Peng, H., Lin, Z., Deng, Z., Kong, X.D.# and Qu, X.# Engineering the substrate specificity of a P450 dimerase enables the collective biosynthesis of heterodimeric tryptophan-containing diketopiperazines. Angew Chem. Int. Ed., 2023, e202304994.

    •  

    Kong, X.D., Carle, V., Díaz-Perlas, C., Butler, K., Heinis, C.# Generation of a large peptide phage display library by self-ligation of whole-plasmid PCR product. ACS Chem. Biol., 2020, 15, 2907–2915.

  • •  

    Kale, S.S.*, Villequey, C.*, Kong, X.D.*, Zorzi, A., Deyle, K., Heinis, C#. Cyclization of peptides with two chemical bridges affords large scaffold diversities. Nat. Chem., 2018, 10, 715-723.

    •  

    Kong, X.D., Moriya, J., Carle, V., Pojer, F., Abriata, L.A., Deyle, K., Heinis, C. De novo development of proteolytically resistant therapeutic peptides for oral administration. Nat. Biomed. Eng., 2020, 4, 560–571.

    •  

    Kong, X.D., Yuan, S.G., Li, L., Chen, S., Xu, J.H.# and Zhou, J.# Engineering of an epoxide hydrolase for efficient bioresolution of bulky pharmaco substrates. Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2014, 111, 15717-15722.

    •  

    Kong, X.D., Ma, Q., Zhou, J.#, Zeng, B.B.# and Xu, J.H.# A smart library of epoxide hydrolase variants and the top hits for synthesis of (S)-beta-blocker precursors. Angew Chem. Int. Ed., 2014, 53, 6641-6644.

教學情況

  • 生物化學F (48學時,秋季學期)
  • 國家重點研發計劃合成生物學重點專項“高值化合物生物合成體系的智能組裝及高效運行”(2021/01~2025/12,參與)        65萬
  • 自然科學基金青年項目“噬菌體展示的多靶標並行篩選策略” (2022/01~2024/12,主持)        30萬
  • 國家重點研發計劃合成生物學重點專項“生物碳鏈延長與儲能細胞的設計與構建”(2022/01~2026/12,參與)        165萬
  • 企業橫向技術開發“靶向環肽分子篩選” (2022/09~2025/08🐢,主持)        100萬
  • 自然科學基金面上項目“蛋白可溶性的噬菌體輔助進化及其機製解析” (2024/01~2027/12👍,主持)        50萬

承擔項目

學生培養

  • 在讀學生
  • 畢業學生
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