楊立桃

長聘教授

  • 電話:+86-021-34207174
  • 郵箱🤙🏿:yylltt@sjtu.edu.cn
  • 地址:上海市東川路800號 生物藥學樓1號樓101👨🏽‍🔧;2號樓519
  • 實驗室網址:http://zhanglab.sjtu.edu.cn/
  • 教育部新世紀優秀人才、上海市東方學者特聘教授、上海市晨光學者、上海市青年科技啟明星。主要從事生物新技術產品安全檢測與評價研究🕸,在Anal Chem🎯、 Lab Chip♕⟹、 Plos Genetics等發表論文100余篇,製定國際和國家標準30余項;獲省部級科學技術進步獎一等獎3項。

學術經歷

  • 1998.09-2002.07,南京大學,生命科學EON4,學士
  • 2002.09-2006.05,南京大學,生命科學EON4,博士
  • 2006.06-2009.12,EON体育4生命科學與技術EON4,助理研究員
  • 2008.07-2008.09👱🏿‍♂️,斯洛文尼亞🌪,國家生物技術研究所,訪問學者
  • 2008.06-2008.07,比利時,農林漁業研究所🌹,訪問學者
  • 2010.01-2016.12🏋🏿‍♂️,EON体育4生命科學與技術EON4,副教授
  • 2013.12-2014.12👨🏽‍🏫,美國🛡,加州大學河濱分校♥️,訪問學者
  • 2017.01-至今,EON体育4生命科學與技術EON4🟧,教授
  • 2015年 — 至今 歐盟轉基因生物安全檢測實驗室網絡官方會議 永久觀察員
  • 2014年 — 至今  國際標準化組織“Molecular Analysis”分委會委員

研究方向

基因編輯和RNAi等生物新技術與產品的安全性檢測與評價

基因編輯和RNAi等技術已逐步應用於分子輔助育種,基因編輯和RNAi等新技術產品的安全性仍有較多爭議。課題組重點圍繞生物新技術產品的分子特征識別🐍⛹🏼‍♀️、遺傳穩定性等安全性檢測和評價方面的難點開展研究工作🏌🏽,系統的建立其安全性評價技術體系和方法。

核酸分子檢測新技術和新裝置開發

針對核酸多靶標和快速檢測的需要🧓🏽,基於向導性核酸內切酶、微流控、3D打印、高通量測序等手段🐕👱🏽‍♂️,研究核酸多靶標分子的快速、高通量、可視化現場檢測新方法和裝置,開發配套檢測產品🫄🏿,應用於農產品安全、食品安全🤷🏼🧌、環境汙染和臨床分子診斷等領域。

轉基因生物安全檢測與評價

針對轉基因生物研發和產業化的國家需求以及轉基因生物安全性的學科前沿,重點圍繞轉基因產品分子特征識別、檢測和方法標準化開展理論和創新研究工作,建立轉基因產品分子特征精準、全面的識別新策略和算法,轉基因成分快速高通量檢測新方法,製定國際國家標準、研製轉基因生物標準物質。

代表論著

  • •  

    Zaobing Zhu, Rong Li, Hanwen Zhang, Jinyue Wang, Yongyi Lu, DabingZhang, LitaoYang. PAM-free loop-mediated isothermal amplification coupled with CRISPR/Cas12a cleavage (Cas-PfLAMP) for rapid detection of rice pathogens. Biosensors and Bioelectronics. 2022 Feb12 . doi: 10.1016/j.bios.2022.114076

    •  

    Zhang H, Li R, Guo Y, Zhang Y, Zhang D, Yang L. LIFE-Seq: a universal Large Integrated DNA Fragment Enrichment Sequencing strategy for deciphering the transgene integration of genetically modified organisms. Plant Biotechnol J. 2022 Jan 6. doi: 10.1111/pbi.13776.

    •  

    Liu Q, Guo X, Xun G, Li Z, Chong Y, Yang L, Wang H, Zhang F, Luo S, Cui L, Zhao P, Ye X, Xu H, Lu H, Li X, Deng Z, Li K, Feng Y. Argonaute integrated single-tube PCR system enables supersensitive detection of rare mutations. Nucleic Acids Res. 2021 Apr 27:gkab274. doi: 10.1093/nar/gkab274.

    •  

    Yijie Wang, Rong Li, Zaobing Zhu, Zheng Yuan, Chen Wang, Li Wang, Dabing Zhang, Litao Yang. In vitro Argonaute cleavage-mediated quantitative PCR facilitates versatile CRISPR/Cas-induced mutant analysis. Sensors and Actuators B: Chemical, 2023, 374, 132781.
    Xueqi Li, Rong Li, Zheng Yuan, Zaobing Zhu, Wenting Xu, Yijie Wang, Dabing Zhang, and Litao Yang*. One Versatile Cas9-Integrated Single-Tube Duplex Quantitative Real-Time PCR System for Rapid Analysis of CRISPR/Cas-Induced Mutants. Anal. Chem. 2022, 94, 30, 10832–10840.
    Xu W, Zhang H, Zhang Y, Shen P, Li X, Li R, Yang L. A paired-end whole-genome sequencing approach enables comprehensive characterization of transgene integration in rice. Commun Biol. 2022 Jul 5;5(1):667.

    •  
    • Zaobing Zhu, Yongkun Guo, Chen Wang, Zifeng Yang, Rong Li, Zhiqi Zeng, Hui Li, Dabing Zhang, Litao Yang. An ultra-sensitive one-pot RNA-templated DNA ligation rolling circle amplification-assisted CRISPR/Cas12a detector assay for rapid detection of SARS-CoV-2. Biosensors and Bioelectronics, 2023, 115179. https://doi.org/10.1016/j.bios.2023.115179.
    •  
    • Yanan Meng, Shu Wang, Jinchao Guo, Litao Yang. Collaborative Ring Trial of the Applicability of a Reference Plasmid DNA Calibrant in the Quantitative Analysis of GM Maize Event MON810. Foods 2022, 11(11), 1538;
    •  
    • Wenting Xu,Ping Shen,Rong Li,Biao Liu andLitao Yang. Development of an Event-Specific Droplet Digital PCR Assay for Quantification and Evaluation of the Transgene DNAs in Trace Samples of GM PRNP-Knockout Goat. Foods 2022, 11(6), 868
  • •  

    Hanwen Zhang, Yuchen Zhang, Wenting Xu, Rong Li, Dabing Zhang, Litao Yang*. Development and performance evaluation of whole-genome sequencing with paired-end and mate-pair strategies in molecular characterization of GM crops: One GM rice 114-7-2 line as an example. Food Chemistry: Molecular Sciences, 2022🚳;4 :100061

    Rong Li, Wenting Xu, Xiujie Zhang, Xueqi Li, Jinjie Cui, and Litao Yang*Ultrasensitive Hexaplex Droplet Digital Polymerase Chain Reaction Assay for Rapid Screening and Quantification of Genetically Modified Content. ACS Agric. Sci. Technol. 2021;1, 390−399 DOI: 10.1021/acsagscitech.1c00104

    •  
    • Yang L, Chen Y, Li R, Xu W, Cui J, Zhang D, Zhang X. Universal LNA Probe-Mediated Multiplex Droplet Digital Polymerase Chain Reaction for Ultrasensitive and Accurate Quantitative Analysis of Genetically Modified Organisms. J Agric Food Chem. 2021 Feb 10;69(5):1705-1713
    • Li R, Chen J, Zhang X, Cui J, Tao S, Yang L. Mini-Disk Capillary Array Coupling with LAMP for Visual Detection of Multiple Nucleic Acids using Genetically Modified Organism Analysis as an Example. J Agric Food Chem. 2020 Jan 22;68(3):899-906.
    • Zhang Y, Zhang H, Qu Z, Zhang X, Cui J, Wang C, Yang L. Comprehensive analysis of the molecular characterization of GM rice G6H1 using a paired-end sequencing approach.  Food Chem. 2020 Mar 30;309:1257-60.
    • Rong Li, Yan Ba, Yu Song, Litao Yang. Rapid and sensitive screening and identification of CRISPR/Cas9 edited rice plants using quantitative real-time PCR coupled with high resolution melting analysis. Food Control. 2020, 112, 107088
    • Li J, Chen Y, Zheng T, Kong L, Zhu S, Sun Y, Deng Z, Yang L*, You D*. Quantitative mapping of DNA phosphorothioatome reveals phosphorothioate heterogeneity of low modification frequency. PLoS Genet. 2019; 15(4):e1008026.
    • Yang Y, Li L, Yang H, Li X, Zhang X, Xu J, Zhang D, Jin W, Yang L*. Development of Certified Matrix-Based Reference Material as a Calibrator for Genetically Modified Rice G6H1 Analysis. J Agric Food Chem. 2018; 66:3708-3715.
    • Shao N, Chen J, Hu J, Li R, Zhang D, Guo S, Hui J, Liu P, Yang L*, Tao SC*. Visual detection of multiple genetically modified organisms in a capillary array. Lab on A Chip. 2017; 17(3):521-529
    • Cheng F, Wu J, Zhang J, Pan A, Quan S, Zhang D, Kim H, Li X, Zhou S, Yang L*. Development and inter-laboratory transfer of a decaplex polymerase chain reaction assay combined with capillary electrophoresis for the simultaneous detection of ten food allergens. Food Chem. 2016. 199:799-808.
    • Pi L, Li X, Cao Y, Wang C, Pan L, Yang L*. Development and application of a multi-targeting reference plasmid as calibrator for analysis of five genetically modified soybean events. Anal Bioanal Chem. 2015, 407: 2877-86.
    • Shao N, Jiang SM, Zhang M, Wang J, Guo SJ, Li Y, Jiang HW, Liu CX, Zhang DB, Yang L*, Tao SC. MACRO: A Combined Microchip-PCR and Microarray System for High-Throughput Monitoring of Genetically Modified Organisms. Anal Chem. 2014. 86: 1269-1276.
    • Zhang M, Liu Y, Chen L, Quan S, Jiang S, Zhang D, Yang L. One simple DNA extraction device and its combination with modified visual loop-mediated isothermal amplification for rapid on-field detection of genetically modified organisms. Anal Chem. 2013. 85: 75-82.

獲獎情況

  • 《主要轉基因產品檢測技術》 獲2004年上海市科學技術進步獎一等獎
  • 《水稻📛▪️、玉米🚅、油菜轉基因產品內標準基因檢測方法及標準化》 獲2012年上海市科學技術進步獎一等獎
  • 《基於基因技術的轉基因產品快速檢測方法》 獲2013年中國分析測試協會科學技術獎二等獎
  • 《轉基因油菜環境安全評價與轉基因檢測技術》 獲2018年中華商業聯合會科學技術獎 一等獎
  • 2008年上海市教育發展基金會晨光人才
  • 2009年 EON体育4傑能科優秀青年教師獎
  • 2009年 EON体育4SMC優秀青年教師 B類
  • 2011年上海市科學技術委員會青年科技啟明星
  • 2013年教育部新世紀優秀人才
  • 2013年EON体育4SMC晨星學者A類計劃
  • 2017年EON体育4李蘭馨優秀青年教師獎
  • 2018年EON体育4晨星教授計劃
  • 2020年上海市東方學者特聘教授

教學情況

  • 2009--2015   動物生物技術
  • 2017--至今    普通生物學
  • 2018--至今   學術寫作🧔🏻、規範與倫理
  • 國家自然科學基金委青年科學基金項目《轉基因抗蟲水稻非預期效應系統生物學評價技術研究》; 
  • 國家863計劃專項課題《4種動物外來疫病通用探針定量 PCR 檢測技術研究及應用》; 
  • 973子課題《外源基因引發非預期效應的分子基礎》; 
  • 上海市國際科技合作基金項目《轉基因水稻檢測技術研究及內標準基因協同驗證》; 
  • 國家自然科學基金面上項目 《基於重測序技術的轉基因水稻分子特征分析及非預期效應評價》
  • 國家科技重大專項《轉基因產品檢測標準物質製備》
  • 國家科技重大專項 《轉基因產品快速、高通量檢測技術》
  • 國家科技重大專項 《轉基因牛和羊轉基因性狀檢測及其自然生態影響監測技術》
  • 863計劃子課題 《水稻智能不育系的創製與應用》
  • 支撐計劃子課題 《食品致敏原分子檢測技術研究》

 

承擔項目

學生培養

  • 在讀學生
  • 畢業學生
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