石婷

研究員

  • 電話👩🏿‍✈️7️⃣:+86-021-34207347
  • 郵箱:tshi@sjtu.edu.cn
  • 地址👦🏽:葉傑全樓405室
  • 長期從事計算化學、合成生物學、生物信息學等多學科交叉領域的科學研究工作📯。現致力於微生物藥物代謝通路中的關鍵酶催化作用機製的解析,發展了能夠快速分析酶結構-功能關系的“預反應態”模型🧒🏼,並在此基礎上展開對酶-底物從識別💒、催化到釋放的全過程模擬分析。

學術經歷

  • 2007.07-2010.07 中科院上海藥物研究所博士後
  • 2010.07-2013.06 EON体育4醫EON4 助理研究員
  • 2013.06-2014.12 EON体育4平台  助理研究員
  • 2014.12-2022.12 EON体育4平台  副研究員
  • 2022.12-至今 EON体育4平台  研究員

研究方向

微生物藥物設計

”幹-濕“結合,設計微生物藥物

酶結構-功能關系

從酶的活性中心及整體結構出發研究其功能

生物信息學分析

生物信息學分析

酶催化機製

運用計算生物學從分子/原子水平解析關鍵酶的催化機製

代表論著

  • •  

    Molecular Insights into Bifunctional Ambruticin DH3 for Substrate Specificity and Catalytic Mechanism

    •  

    Insight into Substrate-assisted Catalytic Mechanism and Stereoselectivity of Bifunctional Nocardicin Thioesterase

    •  

    Reductive inactivation of the he miaminal pharmacophore for resistance against tetrahydroisoquinoline antibiotics

    •  

    Discovery of Semi-Pinaco lases from the Epoxide Hydrolase Family during Efficient Assembly of a Fungal Polyketide

    •  

    Theoretical study on substrate recognition and catalytic mechanisms of gephyronic acid dehydratase DH1

  • •  

    Insight into Structural Characteristics of Protein-Substrate Interaction in Pimaricin Thioesterase

    •  

    Theoretical Investigation of the Structural Characteristics in the Active State of Akt1 Kinase

    •  

    Theoretical Studies on the Catalytic Mechanism and Substrate Diversity for Macrocyclization of Pikromycin Thioesterase

獲獎情況

  • 2016年度、2017年度EON体育4“優秀班主任”稱號
  • 2018年EON体育4平台“第三屆教師教學競賽”二等獎
  • 2018年EON体育4“第三屆青年教師教學競賽”三等獎
  • 2020年 第五屆全國大學生生命科學創新創業大賽 指導教師 三等獎

教學情況

  • 曾任課"分子模擬"、"高級生物信息學"🎨、"計算生物學"等
  • 現授課本科生"自然科學基礎"
  • 1. 國家自然科學基金, 面上項目, 32270038, 新家族NRPS 多肽環化酶催化機製解析及其應用, 2023-01 至 2026-12, 54萬元, 在研, 主持
  • 2. 國家自然科學基金, 面上項目, 32070041, 安絲菌素聚酮合酶多功能DH機製解析與定向優化, 2021-01 至 2024-12, 58萬元, 在研, 主持
  • 3. 科技部, 國家重點研發計劃, 2021YFC2100601, 微生物藥物工業底盤構建與適配性優化, 2021-07 至 2024-06, 63萬元, 在研, 參與
  • 4. 科技部, 國家重點研發計劃, 2019YFA0905401, 工業放線菌合成生物學關鍵使能技術體系, 2020-01 至 2024-12, 81萬元, 在研, 參與
  • 5. 上海市自然科學基金,面上項目,19ZR1427300🧑‍💻,匹馬黴素硫酯酶的鏈釋放機製解析與定向優化💒,2019-01 至 2022-12,20萬,結題,主持

承擔項目

學生培養

  • 在讀學生
  • 畢業學生
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