楊琛

特聘教授

  • 電話:+86-021
  • 郵箱:yang.c@sjtu.edu.cn
  • 楊琛,特聘教授,博士生導師🪴,EON体育4平台

學術經歷

  • 2024/2至今,EON体育4🌤,EON体育4平台,特聘教授
  • 2019,國家傑出青年科學基金
  • 2008/07 – 2024/01,中國科EON4分子植物科學卓越創新中心(原“中國科EON4上海生命科學研究院植物生理生態研究所”),中國科EON4合成生物學重點實驗室,研究員
  • 2008,中國科EON4百人計劃
  • 2004/05 – 2008/07,美國Sanford-Burnham醫學研究所,博士後
  • 2001/10 – 2004/04✶,日本慶應大學🤷‍♀️,先端生命科學研究所,博士後

 

研究方向

合成菌群用於疾病治療

人體腸道內蘊藏著數目巨大的微生物,構成了極為復雜的微生態系統。越來越多的研究表明腸道菌的失調與腫瘤等疾病的發生、發展及預後密切相關。EON体育4平台研究重要腸道共生菌代謝及其調控機製,並設計與構建工程細菌或功能菌群,用於提高腫瘤免疫治療療效及其它疾病治療👩🏽‍🌾。

(1)腫瘤治療的合成微生物學研究🚚。免疫檢查點抑製劑(immune checkpoint inhibitors,ICIs)為許多腫瘤患者帶來福音,已獲批用於多種癌症治療,但是該治療的獲益人群有限。近期研究表明腸道菌的組成與ICIs臨床療效密切相關,糞菌移植在小鼠模型和少數臨床患者中的實踐結果預示腸道菌組成的改變可以克服ICIs耐藥🧚🏽‍♀️🫰🏼。為了擴大腫瘤免疫治療的獲益人群,EON体育4平台基於臨床樣本,采用自下而上(bottom-up)的合成生態學策略,設計與構建腸道菌組合👩‍🏭,研究組合菌引起的腸道菌群生態的改變以及對宿主免疫的調節作用🐕🥞,探討該腸道菌組合對腫瘤ICIs療效的影響😎;同時設計與構建工程細菌✖️,用於腫瘤及其它疾病治療。

(2)腸道共生菌代謝及其調控機製研究🕉。開發人體微生物組數據挖掘與代謝功能預測方法,重構腸道菌中重要的代謝途徑👋,闡明重要腸道共生菌的代謝功能及其調控機製;建立基於代謝建模及仿真的代謝互作預測方法🤚🏿,開發多細胞體系代謝異質性分析技術,研究腸道菌之間以及與宿主之間的代謝互作機製🪓🤳🏽。

二氧化碳人工生物轉化

CO2是最主要的溫室氣體⛹🏿‍♂️,也是巨大的碳資源👩‍👧‍👧。利用合成生物學技術,設計和創建利用光能高效固定CO2的人工生物體系,突破自然光合作用的極限🧙🏼‍♂️,並將CO2轉化為化學品,具有重要的研究意義。EON体育4平台采取師法自然、超越自然的研究策略,研究藍細菌等光能自養微生物中代謝網絡流量的調控機製👨‍👦‍👦,在此基礎上設計與構建高效的人工光合固碳體系。

(1)光合自養代謝流量調控機製研究🚣🏼‍♂️。開發新型代謝流量與代謝組學分析技術🤦🏽‍♀️✯,研究藍細菌等光能自養微生物代謝網絡的動態特征與分子調控機製,定量解析細胞內物質流和能量流的分配模式,揭示光合固碳途徑流量調控以及重要電子載體合成的新機製。

(2)二氧化碳人工生物轉化研究🔉。設計與改造異養或自養細菌,突破半導體材料的光生電子到生物能轉換的瓶頸問題🤰,創建高效的光能驅動固定CO2的半導體-細菌雜合體系🎠,實現化能異養到光能自養的營養類型根本轉變以及人工光合細胞固碳效率的大幅提高🎭。

代表論著

  • •  

    Zhou, J., Xu, S., Li, H., Xi, H., Cheng, W., Yang, C.*. A ribulose-5-phosphate shunt from the Calvin-Benson cycle to methylerythritol phosphate pathway for enhancing photosynthetic terpenoid production. ACS Synth. Biol., 13: 876-887 (2024).

    •  

    Xi, H., Nie, X.*, Gao, F., Liang, X., Li, H., Zhou, H., Cai, Y., Yang, C*. A bacterial spermidine biosynthetic pathway via carboxyaminopropylagmatine. Sci. Adv., 9: eadj9075 (2023).

    •  

    Yao, C., Sun, R., Yang, Y., Zhou, H., Meng, Z., Chi, R., Xia, L., Li, P., Chen, Y., Zhang, G., Sun, H., Lu, S.*, Yang, C*, Wang, Y.*. Accumulation of branched-chain amino acids reprograms glucose metabolism in CD8+ T cells with enhanced effector function and anti-tumor response. Cell Rep., 42: 112186 (2023). 

    •  

    Dong, W., Nie, X., Zhu, H., Liu, Q., Shi, K., You, L., Zhang, Y., Fan, H., Yan, B., Niu, C.*, Lyu, L.D.*, Zhao, G.P., Yang, C.*. Mycobacterial fatty acid catabolism is repressed by FdmR to sustain lipogenesis and virulence. PNAS, 118: e2019305118 (2021).

    •  

    Nie, X., Hua, Q., Xu, P., Yang, C.*. Biological insights into non-model microbial hosts through stable-isotope metabolic flux analysis. Curr. Opin. Biotechnol., 64: 32-38 (2020).

  • •  

    Yang, B., Nie, X., Xiao, Y., Gu, Y., Jiang, W., Yang, C.*. Ferrous iron-activated transcriptional factor AdhR regulates redox homeostasis in Clostridium beijerinckii. Appl. Environ. Microbiol., 86: e02782-19 (2020).

    •  

    Yang, B., Nie, X., Xiao, Y., Gu, Y., Jiang, W., Yang, C.*. Control of solvent production by sigma-54 factor and the transcriptional activator AdhR in Clostridium beijerinckii. Microb. Biotechnol., 13: 328-338 (2020).

    •  

    Nie, X., Dong, W., Yang, C.*. Genomic reconstruction of σ54 regulons in Clostridiales. BMC Genomics, 20: 565 (2019).

    •  

    Zhang, H., Liu, Y., Nie, X., Liu, L., Hua, Q., Zhao, G.P., Yang, C.*. The cyanobacterial ornithine-ammonia cycle involves an arginine dihydrolase. Nat. Chem. Biol., 14: 575-581 (2018).

    •  

    Gao, X., Gao, F., Liu, D., Zhang, H., Nie, X., Yang, C.*.  Engineering the methylerythritol phosphate pathway in cyanobacteria for photosynthetic isoprene production from CO2. Energ. Environ. Sci., 9: 1400-1411 (2016).

獲獎情況

  • 2020年,上海市科技系統三八紅旗手
  • 2020年,中國科EON4朱李月華優秀教師獎
  • 2017年🤨,中國科EON4優秀導師獎

 

  • 國家自然科學基金委員會⚙️,重點項目,32230060🧏🏽,高效光驅固碳人工生物雜合體系的設計與構建,2023/01 – 2027/12🧖‍♂️,在研,主持
  • 國家自然科學基金委員會🧑🏼‍🍳,國家傑出青年科學基金🪵,31925001,微生物代謝流量調控🛝,2020/01 – 2024/12,在研,主持
  • 國家自然科學基金委員會💙,肺癌精準診療關鍵科學問題研究專項👩‍🦯‍➡️,82241228,EGFR突變型肺癌免疫檢查點抑製劑的耐藥機製及幹預策略,2023/01 – 2025/12,在研,參與
  • 國家自然科學基金委員會,創新群體研究項目,31921006,合成微生物與新功能研究,2020/01 – 2024/12,在研,參與
  • 中國科學技術部,國家重點研發計劃,2020YFA0909700🤷🏼‍♀️,微藻底盤細胞的理性設計與系統改造🩸✳️,2021/12 – 2026/11,在研,課題主持

承擔項目

學生培養

  • 在讀學生
  • 畢業學生
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